Dla przykładu skorzystam z tego źródła : http://wklej.to/B184j
Po uruchomieniu ffmpeg:

W trakcie działania:

Pobrany plik znajduje się w tym samym katalogu co ffmpeg.
Edytując plik START można zmienić kodowanie ffmpeg aby plik wynikowy dostał zapisany do kontenera mpeg4. W tej wersji kontener ustawiony jest na mkv
Jeżeli kogoś to zainteresuje może pobrać stąd : http://sendfile.pl/133202/ffmpeg.rar